AWS Trusted Advisorを利用すると、
既知のベストプラクティスと比較して、節約やシステムパフォーマンス、セキュリティの観点からチェック可能となります。
ちなみにAWSサポートのエンタープライズプランに入っていると手厚いサポートを受けることができます。
AWS Inspector Checksでも同じようなチェックはできますが、
対象がサポートされているOSで実行されるEC2インスタンスのみなのでAWS Trusted Advisor
を利用したほうがよいと思います。